Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PGDP52209 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PGDP52209 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PGDP52209 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PGDP52209 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PGDP52209 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGDP52209 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGDP52209 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGDP52209 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PGDP52209 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGDP52209 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PGDP52209 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PGDP52209 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PGDP52209 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PGDP52209 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PGDP52209 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms