Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RND2P52198 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RND2P52198 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RND2P52198 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RND2P52198 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RND2P52198 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RND2P52198 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RND2P52198 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RND2P52198 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RND2P52198 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms