Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR3P51677 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR3P51677 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR3P51677 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR3P51677 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR3P51677 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR3P51677 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR3P51677 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR3P51677 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR3P51677 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR3P51677 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR3P51677 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR3P51677 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR3P51677 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR3P51677 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR3P51677 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms