Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GATMP50440 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATMP50440 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATMP50440 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATMP50440 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GATMP50440 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GATMP50440 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GATMP50440 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GATMP50440 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GATMP50440 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GATMP50440 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GATMP50440 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATMP50440 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATMP50440 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATMP50440 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATMP50440 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GATMP50440 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATMP50440 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATMP50440 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATMP50440 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GATMP50440 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GATMP50440 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms