Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LIG4P49917 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIG4P49917 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIG4P49917 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIG4P49917 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIG4P49917 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIG4P49917 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIG4P49917 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIG4P49917 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIG4P49917 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIG4P49917 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LIG4P49917 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIG4P49917 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIG4P49917 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIG4P49917 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIG4P49917 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG4P49917 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG4P49917 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIG4P49917 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG4P49917 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIG4P49917 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIG4P49917 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIG4P49917 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LIG4P49917 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG4P49917 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG4P49917 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LIG4P49917 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms