Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RARRES1P49788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RARRES1P49788 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARRES1P49788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms