Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLK1P49759 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLK1P49759 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLK1P49759 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLK1P49759 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CLK1P49759 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CLK1P49759 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CLK1P49759 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLK1P49759 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLK1P49759 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CLK1P49759 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CLK1P49759 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CLK1P49759 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CLK1P49759 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms