Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUMBP49757 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUMBP49757 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUMBP49757 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUMBP49757 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUMBP49757 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUMBP49757 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUMBP49757 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms