Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HCAR3P49019 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HCAR3P49019 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms