Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITPNBP48739 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PITPNBP48739 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms