Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PIP4K2AP48426 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PIP4K2AP48426 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PIP4K2AP48426 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms