Protein–RNA interactions for Protein: P47928

ID4, DNA-binding protein inhibitor ID-4, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID4P47928 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ID4P47928 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ID4P47928 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ID4P47928 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ID4P47928 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ID4P47928 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ID4P47928 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ID4P47928 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ID4P47928 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ID4P47928 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ID4P47928 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ID4P47928 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ID4P47928 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ID4P47928 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ID4P47928 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ID4P47928 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ID4P47928 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ID4P47928 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ID4P47928 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ID4P47928 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ID4P47928 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms