Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL27AP46776 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL27AP46776 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms