Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDKN1BP46527 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDKN1BP46527 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms