Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATRXP46100 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATRXP46100 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATRXP46100 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRXP46100 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRXP46100 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRXP46100 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATRXP46100 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRXP46100 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATRXP46100 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATRXP46100 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATRXP46100 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATRXP46100 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATRXP46100 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRXP46100 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRXP46100 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRXP46100 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATRXP46100 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATRXP46100 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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