Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USP5P45974 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USP5P45974 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USP5P45974 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USP5P45974 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USP5P45974 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
USP5P45974 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP5P45974 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP5P45974 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP5P45974 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
USP5P45974 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP5P45974 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP5P45974 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
USP5P45974 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
USP5P45974 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
USP5P45974 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
USP5P45974 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
USP5P45974 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP5P45974 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP5P45974 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
USP5P45974 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
USP5P45974 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
USP5P45974 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP5P45974 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
USP5P45974 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
USP5P45974 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP5P45974 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms