Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCG1P45844 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms