Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC1A1P43005 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC1A1P43005 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms