Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GRIA2P42262 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GRIA2P42262 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA2P42262 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms