Protein–RNA interactions for Protein: P41250

GARS, Glycine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARSP41250 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GARSP41250 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GARSP41250 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GARSP41250 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GARSP41250 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GARSP41250 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GARSP41250 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GARSP41250 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GARSP41250 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GARSP41250 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GARSP41250 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GARSP41250 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARSP41250 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARSP41250 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARSP41250 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms