Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 YIF1YNL263C 945 nt5.03□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 HXT7YDR342C 1713 nt5.03□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 HXT6YDR343C 1713 nt5.03□□□□□ -1.6
SHQ1P40486 YDL027CYDL027C 1263 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ASP1YDR321W 1146 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ECT1YGR007W 972 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 KGD1YIL125W 3045 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 AKL1YBR059C 3327 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 RRB1YMR131C 1536 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 TOS3YGL179C 1683 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 SEC9YGR009C 1956 nt5.02□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ASK10YGR097W 3441 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 TUB3YML124C 1338 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ATH1YPR026W 3636 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YTA6YPL074W 2265 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 RSM10YDR041W 612 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 SCS2YER120W 735 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 NPY1YGL067W 1155 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 BNS1YGR230W 414 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 FAA4YMR246W 2085 nt5.01□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 PAN1YIR006C 4443 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 NOC4YPR144C 1659 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YHR095WYHR095W 495 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YHR145CYHR145C 357 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ECM2YBR065C 1095 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ADE6YGR061C 4077 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 PRT1YOR361C 2292 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 GCR2YNL199C 1605 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 PXA1YPL147W 2613 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ATM1YMR301C 2073 nt5□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YER084WYER084W 387 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 RPP0YLR340W 939 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YLR346CYLR346C 306 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 CSR1YLR380W 1227 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YIM1YMR152W 1098 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YOR342CYOR342C 960 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 AIM10YER087W 1731 nt4.99□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 HNT2YDR305C 654 nt4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ZPR1YGR211W 1461 nt4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 APM4YOL062C 1476 nt4.98□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YFR035CYFR035C 345 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 OAZ1YPL052W 879 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 YPL191CYPL191C 1083 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 MCM4YPR019W 2802 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 MBP1YDL056W 2502 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 VHS2YIL135C 1311 nt4.97□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 ARN1YHL040C 1884 nt4.96□□□□□ -1.61
SHQ1P40486 SRV2YNL138W 1581 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 KAP114YGL241W 3015 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YDR545C-AYDR545C-A 480 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YEL077W-AYEL077W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YER190C-BYER190C-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YFL068WYFL068W 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YGR296C-BYGR296C-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YHL050W-AYHL050W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YHR219C-AYHR219C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YLL066W-AYLL066W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YLL067W-AYLL067W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 MID2YLR332W 1131 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YLR466C-AYLR466C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YLR467C-AYLR467C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YML133W-BYML133W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 AIF1YNR074C 1137 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 PZF1YPR186C 1290 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ARC40YBR234C 1155 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 HIR2YOR038C 2628 nt4.96□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 FUM1YPL262W 1467 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ATG1YGL180W 2694 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YER158CYER158C 1722 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 HPC2YBR215W 1878 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 PEX7YDR142C 1128 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 CAB1YDR531W 1104 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YGR066CYGR066C 879 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 GPP1YIL053W 753 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 KRE9YJL174W 831 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 CCS1YMR038C 750 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SWP1YMR149W 861 nt4.95□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SAP155YFR040W 3009 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 PRP43YGL120C 2304 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SWI3YJL176C 2478 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 SNA2YDR525W-A 240 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 RIP1YEL024W 648 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YLF2YHL014C 1218 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 YJR012CYJR012C 624 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 CBT1YKL208W 816 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 BUD17YNR027W 954 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 ATG14YBR128C 1035 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 PAH1YMR165C 2589 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 PDR15YDR406W 4590 nt4.94□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 MSC7YHR039C 1935 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.93□□□□□ -1.62
SHQ1P40486 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.93□□□□□ -1.62
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