Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEACAM6P40199 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CEACAM6P40199 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms