Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD12P35452 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD12P35452 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD12P35452 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms