Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORAP35398 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RORAP35398 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RORAP35398 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORAP35398 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORAP35398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORAP35398 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORAP35398 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORAP35398 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORAP35398 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORAP35398 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORAP35398 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORAP35398 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORAP35398 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORAP35398 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms