Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
BMI1P35226 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BMI1P35226 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BMI1P35226 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
BMI1P35226 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms