Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HSPA4P34932 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HSPA4P34932 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms