Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NTF4P34130 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NTF4P34130 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NTF4P34130 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NTF4P34130 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NTF4P34130 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NTF4P34130 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NTF4P34130 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NTF4P34130 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NTF4P34130 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NTF4P34130 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms