Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCM5P33992 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCM5P33992 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MCM5P33992 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCM5P33992 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM5P33992 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCM5P33992 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCM5P33992 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCM5P33992 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCM5P33992 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCM5P33992 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM5P33992 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM5P33992 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCM5P33992 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCM5P33992 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCM5P33992 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MCM5P33992 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms