Protein–RNA interactions for Protein: P33076

CIITA, MHC class II transactivator, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIITAP33076 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIITAP33076 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIITAP33076 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIITAP33076 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CIITAP33076 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CIITAP33076 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CIITAP33076 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CIITAP33076 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CIITAP33076 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIITAP33076 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CIITAP33076 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CIITAP33076 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CIITAP33076 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CIITAP33076 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIITAP33076 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIITAP33076 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIITAP33076 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIITAP33076 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CIITAP33076 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIITAP33076 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIITAP33076 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CIITAP33076 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CIITAP33076 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms