Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL9P32969 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL9P32969 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL9P32969 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL9P32969 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RPL9P32969 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RPL9P32969 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RPL9P32969 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RPL9P32969 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL9P32969 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL9P32969 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL9P32969 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL9P32969 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPL9P32969 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL9P32969 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL9P32969 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPL9P32969 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL9P32969 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL9P32969 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPL9P32969 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPL9P32969 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPL9P32969 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms