Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GTF2H1P32780 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GTF2H1P32780 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms