Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CPS1P31327 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CPS1P31327 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CPS1P31327 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPS1P31327 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CPS1P31327 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPS1P31327 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPS1P31327 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPS1P31327 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPS1P31327 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CPS1P31327 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CPS1P31327 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPS1P31327 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPS1P31327 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPS1P31327 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CPS1P31327 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPS1P31327 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CPS1P31327 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CPS1P31327 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
CPS1P31327 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
CPS1P31327 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPS1P31327 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CPS1P31327 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
CPS1P31327 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CPS1P31327 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPS1P31327 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPS1P31327 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPS1P31327 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
CPS1P31327 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPS1P31327 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPS1P31327 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPS1P31327 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPS1P31327 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms