Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CMPK1P30085 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CMPK1P30085 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms