Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RBMS1P29558 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RBMS1P29558 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RBMS1P29558 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBMS1P29558 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBMS1P29558 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBMS1P29558 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RBMS1P29558 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms