Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EPHA3P29320 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EPHA3P29320 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EPHA3P29320 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms