Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMOD1P28289 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD1P28289 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD1P28289 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms