Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HLA-DMAP28067 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HLA-DMAP28067 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms