Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA1P25786 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PSMA1P25786 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSMA1P25786 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms