Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LAMA1P25391 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LAMA1P25391 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms