Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PTAFRP25105 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTAFRP25105 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms