Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP5F1P24539 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ATP5F1P24539 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms