Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EIF4BP23588 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EIF4BP23588 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4BP23588 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms