Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRGP23470 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRGP23470 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
PTPRGP23470 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
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