Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPS6KB1P23443 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPS6KB1P23443 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPS6KB1P23443 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms