Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCSHP23434 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCSHP23434 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCSHP23434 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GCSHP23434 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GCSHP23434 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GCSHP23434 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GCSHP23434 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GCSHP23434 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms