Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMPD1P23109 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMPD1P23109 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMPD1P23109 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms