Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PRKACGP22612 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKACGP22612 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKACGP22612 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms