Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FGFR3P22607 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FGFR3P22607 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FGFR3P22607 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms