Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCP2P22307 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCP2P22307 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCP2P22307 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SCP2P22307 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCP2P22307 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCP2P22307 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCP2P22307 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCP2P22307 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCP2P22307 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCP2P22307 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCP2P22307 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCP2P22307 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCP2P22307 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCP2P22307 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCP2P22307 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCP2P22307 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCP2P22307 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCP2P22307 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCP2P22307 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCP2P22307 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCP2P22307 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCP2P22307 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCP2P22307 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCP2P22307 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCP2P22307 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCP2P22307 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCP2P22307 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCP2P22307 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCP2P22307 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCP2P22307 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms