Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH3P22223 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH3P22223 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH3P22223 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH3P22223 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH3P22223 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH3P22223 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH3P22223 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH3P22223 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH3P22223 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH3P22223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH3P22223 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms